癫痫灶的电生理病理学变化对手术至关重要，主要病理基础是神经元的病理兴奋和减少对病理性放电扩散的抑制。
1、先天脑发育畸形:如无脑回畸形，巨脑回畸形，多小脑回畸形，灰质异位症，脑穿通畸形，先天性脑积水肼胝体发育不全，蛛网膜囊肿，头小畸形，巨脑症等。其中，巨脑回畸形为不完全性脑回缺如，只表现为参与脑回减少，体积增大。巨脑回畸形首先是脑回减少，严重者可仅有主要脑回，巨脑回畸形常常合并无脑回畸形。
2、神经皮肤综合症:比较常见的有结节性硬化，神经纤维瘤病和脑三叉血管瘤病等。神经纤维瘤病是一种少见的遗传性疾病，其特征是皮肤色素沉着斑和多发性神经纤维瘤。约25-50 患者有阳性家族史。
3、遗传代谢病:遗传代谢病就是有代谢功能缺陷的一类遗传病，多为单基因遗传病，包括代谢大分子类疾病:包括溶酶体贮积症(三十几种病)、线粒体病等等，代谢小分子类疾病:氨基酸、有机酸、脂肪酸等。如苯丙酮尿症、高氨血症、脑脂质沉积症、维生素B6依赖症等。
4、围产期脑损伤:主要是产伤、窒息、颅内出血、缺氧、缺血性脑病，中其以缺氧缺血性脑病而致癫痫者比较常见。
5、颅内感染:如细菌性脑膜炎、病毒性脑炎、脑脓肿、霉菌性脑膜炎、脑寄生虫病、接种后脑炎、传染后脑炎等。
6、营养代谢障碍及内分泌疾病:常见有的低血糖、低血钙、低血镁、维生素B6缺乏，甲状腺功能低下。
7、脑血管病:如脑血管畸形、颅内出血、脑血管炎、脑梗塞等。
8、外伤:由外伤而致的颅内出血、颅骨骨折、脑挫裂伤等均可引起癫痫，但发病率与损伤程度及部位有关。
9、高热惊厥:高热惊厥后脑损伤也导致癫痫。不论哪种原因引起的癫痫，积极治疗原发病，迅速控制发作，接受正规、合理、无毒副作用的治疗是疾病顺利康复的保证。
通过对各种癫痫，包括隐原性颞叶癫痫以及热性发作后或其他早年的脑损伤后癫痫，以及头外伤动物模型和化学物质诱导的癫痫发作的观察黑龙江中亚癫痫病医院患者评价，对于海马硬化是癫痫发作的原因还是其影响存在激烈的争论。海马硬化可能代表了不同原因导致部分性癫痫的病理比较终共同路径。对海马硬化形态学改变的细致研究，引出了对在海马硬化下癫痫发生机制的几种假说。比较明显的改变是齿状颗粒细胞的苔藓纤维轴突出芽。正常情况下，海马的兴奋性传入信号由相邻的内嗅皮质直接传入海马齿状颗粒细胞，反之抑制性传入信号起源于局部深层分子层的中间神经元。齿状颗粒细胞的苔藓纤维轴突出芽，延伸到锥体神经元并作为海马传出通路的一部分。正常的齿状颗粒细胞对高度同步活化呈现一定的抵抗力黑龙江中亚癫痫病医院患者评价，并且可能实际上抑制来自内嗅皮质的癫痫发作的蔓延。在海马硬化中，齿状颗粒细胞出芽的苔藓纤维轴突指向相反的深层分子层，可能是由于它们通常延伸的神经元发生了缺失。有证据指出这些异常的苔藓纤维，在相邻齿状颗粒细胞的树突上形成突触，激起一个周期性的兴奋循环。虽然这样一个循环对高兴奋性给出了一个似乎合理的解释，但对苔藓纤维轴突出芽在引起癫痫发生上所起的作用仍主要是猜测。例如黑龙江中亚癫痫病医院患者评价，有很强的证据指出，作为反馈机制的一部分，新出芽的轴突也和抑制性中间神经元形成突触，而不是简单的增加兴奋性。
